号召开放科学学生领袖

托马斯·奈特和马特·托德的照片

资料来源:由Mat Todd提供

托马斯·奈特(左),第一个詹姆斯·默里爵士学生冠军之一,一个以马特·托德的众包英雄之一(右)命名的团体

在领导开源药物研发企业17年之后,马特·托德(Mat Todd)非常熟悉公开分享数据的好处和挑战。

“作为一种文化,科学本质上是相当神秘的,”托德解释道。“我们(科学家)希望确保我们在某些方面为人所知。因此,关键在于管理好两件事:一是分享的需要,因为这是更好的科学;二是控制所传播内容的需要。

Todd是英国伦敦大学学院的药物发现教授,他创立了几个开源财团,每个财团的目标都是找到更好的药物来治疗那些严重影响世界穷人的疾病,如血吸虫病、疟疾、结核病和足菌肿。每个联盟的核心理念都认为,通过众包世界各地研究人员的贡献,并努力使所有讨论、数据和决策透明,有可能更快、更便宜地找到新药。

到目前为止,大多数众包的贡献都是以专家的科学建议或新分子的合成或生物学评估的形式出现的,但最近托德提出了一种不同的投入——项目管理。

他的新角色是化学网络的负责人结构基因组学联盟(SGC), Todd已经建立了詹姆斯·默里爵士学生冠军,旨在帮助年轻研究人员在项目协调、数据管理、沟通和传播等方面发挥重要作用。其中一些关键任务可能会在多个贡献者具有竞争优先级的项目中遗漏,希望冠军能够缓解这些挑战。

托德研究小组的博士生托马斯·奈特(Thomas Knight)是第一批自愿担任该职位的人之一,他说:“地方冠军就像一个中心枢纽,把拥有不同科学经验和专业知识的人聚集在一起,把他们的集体智慧集中在一个共同的目标上。”“这就是大型制药公司的运作方式,作为当地的领军企业,我们希望尝试在学术环境中复制这种高效的行业模式,即开放合作和最后期限。”

奈特正在协调一个针对Sars-CoV-2的潜在蛋白质靶点的开放项目。冠军们将要参与的许多项目都是SGC雄心勃勃的项目的一部分,Target2035,旨在为人体中的每一种蛋白质找到一种化学或生物探针;最终导致更好的治疗和诊断疾病。

冠军是以托德早期众包英雄之一詹姆斯·默里(James Murray)的名字命名的,他是第一本牛津英语词典的馆长。托德解释说:“当时有一个众包活动,以确定单词的首次使用……人们阅读小说并找到例子。”默里协调了整个竞选活动,收到了来自公众的大量捐款,邮局不得不在他家门口竖起一个邮箱。这种努力类似于托德在众包科学中看到的潜在好处:“从混乱的雪崩般的贡献中提取出一些伟大的东西。”

默里的方法欢迎任何人的贡献,这是对开放科学的另一个目标——民主化的认可。托德说:“詹姆斯·默里非常了解EDI(公平、多样性和包容性)问题。他希望能从代表性不足的行业获得大量投入。我认为这确实发生了。他确实收到了很多捐款,这些捐款来自那些可能没有在正式学术环境下捐款的学术证书的人,但他们能够通过另一种方式——以贡献者的身份邮寄东西——产生巨大的影响。我想这与开放科学的目标产生了很好的共鸣。”

学生冠军被邀请以作者的身份贡献研究论文,并学习项目管理的可转移技能。奈特说:“作为一名本科生,你的教育主要是被告知要学什么,在实验室里要做什么研究。”“这个项目需要我们从化学的角度进行广泛思考,但也要考虑到每个参与者如何最有效地利用他们的专业知识,使项目尽可能顺利地进行。”

托德和他的SGC同事正在寻找更多的学生申请成为冠军,奈特很享受这个角色。他说:“我们正在探索新的化学物质,但它有一个目的,那就是防止未来的冠状病毒大流行。”

奈特也对这个项目的合作方面感到兴奋:“我们将来自世界各地不同学术机构的研究人员聚集在一起,他们愿意忽视‘需要知道的基础’的研究方式,而是愿意在更早的阶段将他们的研究推向世界。”

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