行为指纹指向潜在的药物

小说筛查方法,探讨斑马鱼的行为以应对成千上万不同的小分子可以帮助加快药物开发过程中,根据美国研究人员。可能是特别有价值的方法在寻找治疗精神疾病。

斑马鱼已成为广泛应用的生物模型在药物发现。灵感来自平行与斑马鱼基因筛查,亚历山大Schier哈佛大学和他的团队开发了一种高通量技术,一个斑马鱼幼体是用移液器吸取到每个96孔板,以及药物或潜在的药物,使用计算机软件和监控。通过这种方式,他们可以生成一个行为“条形码”或“指纹”为每个化合物他们测试。

我们做很多实验基因表达的分析,我们认为,或许我们可以使用相同的聚类方法应用于基因表达分析,但对于行为分析,“Schier解释道。”这是概念上的突破——当我们意识到我们有一个巨大的数据集,我们有这些指纹,我们可以组织他们使用聚类算法已用于基因表达分析。

使用这种方法,Schier的团队筛选近4000独特的结构和行为概要文件记录了超过60000的幼虫在短短几年,展示屏幕的巨大的潜力。通过分析这些化合物如何影响鱼的睡眠或清醒模式他们能够组织化合物为药物可能的迹象。一个特定的分子,例如夫人- 1220集群与抗抑郁药物化合物。Schier认为这项技术可以用来弥补细胞培养和啮齿动物的研究有助于描述大量的药物非常迅速。

苏郭,药物化学家研究斑马鱼行为在加州大学,旧金山,由Schier感兴趣的方法。这是一个相当新颖和空前的想法使用斑马鱼行为作为药物筛选的体内读出,”郭说。因为行为是如此复杂,然而,她认为,真正的挑战是仍然领先,算出的化学物质做什么在分子和细胞水平。

但是Schier说他的技术提供的行为信息,是至关重要的发展精神药物。的行为是许多神经元相互作用的新兴财产,不能在一道菜——你不能减少学习行为的一群细胞文化,”他说。你可以研究方面,如囊泡释放,或通道开放,但是这在整个动物的背景下,这是极其困难,到目前为止,无法模仿的文化。”

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