新的计算研究可以帮助科学家解开结的蛋白质

一项新的研究可能会帮助科学家们解开复杂的蛋白质折叠问题。的研究显示结蛋白折叠专家提出了特别的挑战,可以解开的精准的拖船。

蛋白质折叠蛋白质功能密切相关。折叠过程,然而,仍然有一些神秘和由于其速度几乎是不可能的去观察。结蛋白,发现最近,令人困惑,因为目前还不清楚如何通过折叠到目前为止发现的任何路线。实验,也很难判断已经变性蛋白质仍打结或不是。

乔安娜Sulkowska圣地亚哥加州大学在美国和他的同事们已经采用计算方法表明,在methylotransferase结蛋白可能的拉着正确的残留物。使用简单的方程,他们确定结及其关键残留相对于蛋白质的目的。分子动力学模拟支持的想法将在正确的地方结方法。

结- 410

来源:©j . Am.Chem。Soc。

左:团队确认12“拉”点在这个结蛋白(黄点)。中间:圆圈表示在三叶草结拉点。右:最后的蛋白质构象拉后绕点

”到现在为止没有办法展开的蛋白质和本文表明,是的,你可以解开它,但是你需要把在非常特定的地点,“Sulkowska说。“然后你就可以研究完整的折叠机制。Sulkowska解释说,正确的地点,可以作为悬臂附件网站提示,可以用来解开原子力显微镜下的一个结。她说的方法应该适用于所有结到目前为止发现的蛋白质。

的工作将重要解释机械展开研究,”苏菲说杰克逊,蛋白质折叠问题专家剑桥大学的英国。但她补充说,机械展开是热的“特殊情况”——展开和化学变性实验所得不同的路线。

希娜•雷德福利兹大学的研究折叠机制,英国,认为工作是有趣的,但留下了许多想象。虽然它可以让我们看看你是否可以解开一个蛋白质,当你把它从不同的方向,我不认为对我来说回答这个问题是最迷人的,这是生物怎么打结在第一时间。”这就像问一个三岁的解开鞋带,她说,这可能是容易,但re-knotting将更加困难。

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