信息学工具可以帮助研究人员想象复杂的毒性数据集

帮助预测和避免有毒的纳米材料,设计研究人员创建一个信息工具,可以退出,想象关键信息从大量复杂的纳米材料的研究

纳米材料是现在常见的商业产品,如服装和清洗剂,和研究潜在的不利的环境和健康的影响呈指数增加。然而,没有全面的方法来比较,或想象,这些信息可以帮助研究人员发现纳米材料属性之间的相关性及其毒性。以及大量的信息,不同的研究也常常考虑不同实验条件和生物材料,使它很难直接比较数据。

现在,桑德拉因为Karcher卡内基梅隆大学,美国,和她的团队设计了N4mics,一个工具,可以想象纳米毒性研究斑马鱼中存储Nanomaterial-Biological交互知识库。因为Karcher说:“我们开发这个工具作为实验演示如何挖掘数据标准化和共享创造视觉对比纳米材料类型。这些可视化用于生成小说假设这些材料的属性如何影响其毒性的潜力。”

团队展示了N4mics,供公众使用,可以挖掘数据从151年斑马鱼研究;用户可以选择数据子集等纳米材料与特定的核心结构,然后想象结果通过生物反应或他们感兴趣的纳米材料的组合特征。因为Karcher数据挖掘表明毒性强烈与纳米材料的外壳的组件,而不是其他属性如大小。

维姬Grassian纳米科学专家及其对健康和环境的影响在加州大学圣地亚哥分校,说:“这个可视化工具是脱落的一步对我们理解structure-property-hazard关系而不是底层机制需要了解风险的原因。

因为Karcher团队现在正致力于识别最好的数据收集格式,这样他们可以设计其他工具,可以回答更多的问题。