化学在生物

生化途径是著名的复杂和相互关联的,所以毫无疑问,描写它们中的大多数都需要简化。即便如此,这些图是绝对可怕的复杂性。圆圈和三角形被线连接(固体和虚线),箭头指向较大和较小的多边形的不同色调。很可能是没有其他办法任何画面的这些东西,每个人都意识到这类图的局限性。他们可能得到的,往往不做好表示时间的影响,转录的变化,各种各样的变构作用和许多其他因素。但也有其他负面影响的这些插图不那么显而易见。

其中最主要的(在我看来)是这样的漫画让观众忘记他们代表实际的化学物种,这些线条和箭头,所有缩写的尝试真正的物理化学过程。那里的空间抽象这些系统的视野,但最终,什么不是抽象的。正在和破碎的共价键、氢键和非极性交互在一起,分开,亲核试剂与亲电试剂做永恒的舞蹈。化学就像我们化学家理解它;唯一的区别是它的大,比我们使用结构复杂的分子。并没有什么神奇的蛋白质、多糖、寡核苷酸。它们的分子,他们应该这样对待。认为否则是允许活力论蠕变回化学。

越来越多的分子和细胞生物学家一直来接受这个事实:你不能(例如)决定标签一些蛋白质和绿色荧光蛋白(GFP)希望它继续。把它的名字在白板上,旁边的一个明星或重命名它‘Target-GFP’,不捕捉到底发生了什么。您已经创建了一个新的蛋白质,这种新的蛋白质有一个新的形状,一个新的尺寸,很可能完全新的行为。这同样适用于所有的蛋白质轭合物和化学生物探针。很,很难观察生命系统在分子水平上没有扰动的事情你想看,但是现在大量的努力去试图减少这些影响。

分析化学,x射线技术和低温电子显微镜的发展,揭示了越来越多的详细结构不仅单个生物分子,但整个蛋白复合物。看到细胞的转录机械或g蛋白耦合的受体的螺旋线的决议,我们现在可以实现让我们没有选择:我们不仅要考虑自己的组件作为分子物种,但也意识到自己的行为可以打开奇怪微妙的结构性变化。个人官能团能产生巨大的效应的支点绑定时表面,奋进号,这需要整个领土的有机化学。

并没有什么神奇的蛋白质、多糖、寡核苷酸。它们的分子,他们应该这样对待

这个过程肯定会继续下去。所有这些技术仍然是改善,和其他人(也许原子力显微镜或它的一个许多变体?)将被添加到列表的方法,我们可以欣赏生物分子的结构在前所未有的细节。这些进步可能的影响将分子生物学家(慢慢地)转化为化学家,尽管我愿意打赌,这不是大多数人是如何查看流程!但是如果你发现自己想着分子的三维结构,和个人的官能团,我很难看出你不是某种有机化学家。

欢迎来到俱乐部!不要担心——你会发现,在许多方面,有机化学家就像生物学家。我们的实验以不同的方式失败,但失败了,我们使用语言发生时一样鲜艳。我相信同样的规则永远不会拒绝免费食物的研讨会和会议有关在这两个领域,和着装规范似乎并没有太多不同,。拥抱改变,你不会有任何损失,但你的圆圈和三角形。