完整的结构重新分配看到镉、碳和氯取代铼,氮和硫

美国的研究者们已经发现了一个结构,铼被误判为镉,然而有可接受的细化标准出版。1原子与原子序数很难区分使用x射线衍射但这样前所未有的混乱之间原子的原子序数的转变意味着误诊5月27日结构比之前意识到可能是一个更广泛的关注。

[Cd(有限公司)3(C6H3Cl)]4最初是在2011年被报道和Jadavpur bhabi mahato Sammilani学院大学的研究人员在印度,与威尔士大学的科学家合作,英国。2最近,Ged帕金哥伦比亚大学和他的团队测试锌羰基化合物有限公司,有限公司2转换时注意到热椭圆体的镉原子位移的情节(Cd(有限公司)3(C6H3Cl)]4与其他相比不成比例的小原子的结构。看到这个潜在的问题,帕金的团队然后比较获得的x射线衍射实验数据和几何优化的理论结构。他们确定了5个关键差异:C基于“增大化现实”技术-Cd-C基于“增大化现实”技术键角,Cd-Cl距离,羰基配体的性格,Cd-C-O债券角度,平均Cd-CO距离。

一个图像显示原子位移的情节

来源:©杰拉德帕金/哥伦比亚大学

原子位移的情节(Cd(有限公司)3(C6H3Cl)]4(左、数据取自CCDC 185365)和(Re(有限公司)3(C4N2H3S)]4(正确,数据取自CCDC 2024180))

证据表明金属原子可能misassigned,然后团队调查其他原子是否也可能是错的。识别可能的候选人,他们提炼数据到这个新结构,铼取代镉、代替碳、氮和硫取代氯。可靠性因子(R值)结果(3.4%)远低于先前确定的镉细化(6.8%),这表明数学铼结构比镉更适合的数据结构。这是意想不到的情况下一个元素和一个非常不同的电子计数可以误诊且仍然导致起初似乎是一个可以接受的改进,比如在本例中,“评论娜塔莉·约翰逊数据完整性研究科学家在剑桥晶体数据中心(CCDC)在英国。

帕金解释说,20.4%的镉化合物中列出的CSD R值大于6.0%,与一些高达30.1%——因此出版物应该要求较低的R值吗?帕金说绝对没有。可以有一个结构,它有很多征兆checkCIF在一份报告中,R值很大,表现差劲的椭圆体,和大型债券长度标准的不确定性,但化合物是正确地识别。另一方面,人们可以有一个结构,它有一个完美的checkCIF报告,R值较低,表现好椭圆体,和小的标准型不确定性债券长度,但复合是完全错误的,因为原子被误诊。降低一个可接受的R值不会防止发布不正确的结构,但它肯定可以防止新的化学报告。”

帕金认为比较x射线衍射实验数据的计算结构。如果结构达成一致,数据应该是可靠的。如果结构不同意,还需要进一步调查。

关键是我们作为晶体学家们,有力量的检查和纠正过去的错误由于健壮的测试支持的最全面和可靠的晶体数据的集合,在年增长的贡献我们晶体学家们,过去和现在,“评论Alessia Bacchi在意大利帕尔玛大学的,谁是直接过去欧洲晶体协会的主席。镉的奇怪misassignment代替铼强烈警告花时间再确认一个调查异常数据和谦卑,因为固体结晶学的知识给我们的工具。”

帕金希望他的团队的发现将提醒化学家照顾。和补充道,先前的评论由裁判他的论文,也与结构决定,相关报道问题可以完美地总结了他的观点:““即使经历了chemist-crystallographers需要提醒化学如何协力愚弄我们。”“