工具将帮助化学家挑选最好的溶剂的反应
这是一个一步试图鼓励实验思考他们的问题基于理论概念,而无需与理论计算的全部恐怖,”说克里斯托弗·亨特来自英国剑桥大学,他的团队的新模型。1基于实验研究的成对氢保税溶质之间的相互作用,2猎人和他的同事们开发了一种方法来定量预测溶剂将如何影响非共价相互作用和扩展到多个交互站点在任何溶剂的环境。他们还开发了可视化地图,直接实验的网站他们应该调整的极性分子增强所需的交互。
非共价化学坐的大部分的核心功能使用的有机分子。周围几乎所有的有趣的属性有机分子是从他们如何与其他分子,因为大多数应用程序交互发生在溶剂阶段,了解溶剂的影响,这些交互是很有用的。
对于猎人来说,工作是一种爱的劳动。我试图制定如何广场超分子化学文献中,这都是在氯仿中,生物化学文献,都在水里,在一个模型,该模型对两个非常不同的溶剂环境中以同样的方式,这是结果。它从定性模型,在二年级本科生课程,逐渐越来越复杂,现在我们在。”
被称为“官能团交互配置文件”,分子之间的拆开单独点的交互模型。“分子的各个部分的属性,以及它们如何可能会影响性能吗?我的目标是开发一个经验法则的方法实验有机化学家使用相同的方式使用卷曲的箭头思考机制或构象分析考虑三维结构。化学家将有一个模型来思考这些现象不通过模拟。
设计解散
猎人解释说,他的团队已经简化了交互的数字表达式。即使是基本的量子力学计算的静电表面和概要文件是复杂的,所有的方式并入一个相当简单的表达很可用的非专家。和配置文件本身是很容易解释,化学物理专家的评论乔治•杰克逊在英国伦敦帝国理工学院的。
杰克逊说化学家将能够使用它预测,因为这给了信息平衡常数和不同分子之间的结合常数组。这是非常有用的,如果你想设计的东西紧密结合蛋白或如果你想分子和溶剂之间的相互作用是强大的可溶性。之类的能够预测药物分子的溶解性,分子的结合到蛋白质,这些都是至关重要的信息,你需要知道。没有点药物正在开发有效结合蛋白质如果它不会溶于你的胃和进入你的血液。
我认为实验化学家想要的是一个模型,将告诉他们他们的系统是如何表现的,真的,”亨特补充道。“我们还有很长的路要走理论方法能够提供一个可靠的预测在一个复杂的系统。我试图从中提取有用的东西,那就一个实验物理学家的理论计算。布丁的证明是人们是否把它捡起来。”
引用
1 M D驱动程序等,化学。科学。,2020,11,4456 (DOI:10.1039 / d0sc01288b)(本文是开放存取)。
2 C一个猎人,Angew。化学。,Int. Ed.,2004,43,5310 (DOI:10.1002 / anie.200301739)
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