结构性侦查搜救超级细菌杀手

失败后baulamycin superbug-fighting分子,英国研究人员已经推翻了最初分配的化学结构。¹Varinder Aggarwal和他在布里斯托尔大学的同事一直试图使baulamycin A和B都使用'组装线合成的他们开发的方法。但该方法还将回答一个挑战源自于baulamycins的异国情调的起源。

当研究人员包括大卫·谢尔曼美国密歇根大学的海洋细菌中发现了baulamycins从哥斯达黎加他们获得几毫克。²这足以显示他们可以阻止耐甲氧西林的增长金黄色葡萄球菌(耐甲氧西林金黄色葡萄球菌)和炭疽,但工作的结构分子的长,软盘,碳链是困难。链有七个手性中心,周围的原子可以采取两种镜像安排,给了128种不同的可能的立体异构体的选择正确的结构。合适的唯一方法是核磁共振,“很难分配手性中心单独使用核磁共振在高度复杂的结构如baulamycins,”谢尔曼告诉必威体育 红利账户。

Aggarwal流水线的方法可以精确地添加手性中心一个接一个正确的方向,使它适合生产baulamycins。但是他们会让baulamycin的思考之后,他们发现他们的核磁共振数据不匹配原始样品。相反,似乎真正的结构是一个不同的可能比团队发现它已经提出。我们最初惊讶,但当你更深入地调查这个问题你意识到它犯错的几率是相当高的,”布里斯托尔化学家埃迪迈尔斯告诉必威体育 红利账户。

一个分子的两半

之前类似的问题出现,迈尔斯说,但通常天然产品链接在自己相对刚性的戒指。结构因此可以解决预测NMR参数有限数量的构象可以使用计算化学采用环结构。但是因为baulamycin软盘,更多的构象是可能的,复杂的严重挑战,单独不充分的计算方法。

因为布里斯托尔的团队baulamycin分裂成两半,让它,而不是合成和分析所有128结构选择,他们调查每一半。一半,他们比较了NMR数据会计算所有可能的安排与原来的分子。缩小了选择正确的相对安排一半的分子只有一个。

然而,这种方法不能区分四个安排的另一半分子。研究人员因此转向合成,流水线的方法能够精确地生成所有四个安排。通过引入混合两种不同的可能的手性片段在每两个步骤,研究小组制作了一个四分量混合物。确保安排中生成不同数量,所以他们可以很容易地由NMR分化,与原始数据进行比较确定正确的一个。

在确定安排在每个分子的一半,然后团队联系在一起在剩下的四个方面。再次,比较不同产品的原样品核磁共振数据的表示这是最终正确的。

谢尔曼是“非常满意”,布里斯托尔化学家已经修改了两个手性中心,他的团队已经mis-assigned,调用“杰出的”工作。密歇根州的组织正在共同努力,团队将评估不同baulamycin同分异构体的抗菌能力。我们希望看到的立体化学如何影响其活动,”迈尔斯说。