英国的研究人员找到了一个简单的数学过程,有效地抑制了大分子核磁共振信号的定量小分子生物样本留下的数据。
组学是研究复杂的生物系统,如基因、蛋白质和代谢产物,这一领域正越来越多地利用NMR确定小分子或系统(如尿液的代谢物。以及帮助研究人员了解生物过程,这种分析可以诊断。核磁共振有很多优势,非破坏性和定量,所以它在大规模自动化特性广泛代谢组学研究。betway必威游戏下载大全然而,复杂的生物系统包含许多大分子如脂类,蛋白质,和糖,产生非常广泛的核磁共振信号,可以沼泽。大分子面具小分子数据和的职责是核磁共振代谢组学研究人员梳理这个隐藏的信息。
15年来的一组实验过程被武断地跟着“删除这些广泛的信号表示Panteleimon说:伦敦帝国理工学院的。这个过程几乎总是包括一个旋转回声抑制信号从大分子实验。旋转回声实验会占用大量的时间,尽管是无处不在的,说:说他们是“令人惊讶的是在抑制无效的广泛背景信号的。量化过程中信息丢失,消除使用核磁共振的关键优势之一。
塔和他的帝国的同事已经采取一种新的方法的问题,设计一个数学方法消除广泛的背景信号。使这项工作的关键是计算一阶导的NMR谱的虚部,这产生了一个概要的小分子自由广泛的信号和大分子基线干涉。“数字衍生品广泛用于光谱学、不仅仅是核磁共振,但是团队惊讶地发现他们没有经常使用和申请抑制代谢组学管道广泛的核磁共振信号。
他们命名为免费提供方法Smolesy,这是小分子增强光谱学的缩写。它有助于加快代谢物分配的过程,因为它大大提高光谱分辨率,不增加原始数据文件的大小。它也可以应用于已经收集的数据,因此用户不需要运行的新实验。最重要的是,除基线提供了机会来量化代谢产物通过直接集成的Smolesy信号不需要复杂的匹配算法。这最后一点被广泛验证的团队在一个广泛的系统从一组白蛋白的解决方案在不同浓度的一组超过3000血清和血浆样本大流行病学队列研究。
我们工作的最具挑战性的部分是说服自己Smolesy数据复制而不是影响小分子量代谢物的NMR指纹,”塔说。“我们强烈建议Smolesy应该实现和测试在核磁共振代谢组学,foodomics和营养研究每一个实验室的管道。
的计算方法既优雅又看似简单,”说拉斐尔Bruschweiler从俄亥俄州立大学,我们开发技术来分析复杂生物混合物。”的数值色散的一阶导光谱的一部分,他们强调锋利的代谢物感兴趣的信号而叛变的背景。它很可能成为一个标准的工具在代谢组学迅速发展的领域。
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