的长期目标设计RNA-targeting药物得到了提振由于技术,标识有选择性地结合致病药物类小分子RNA。美国团队展示了方法通过设计丙型肝炎的抗病毒药物导致基于其RNA序列和建议的技术可以帮助对抗新病毒株出现季节性流感等。

传统上,药物与蛋白质的折叠设计阻止或破坏活动,负责疾病。然而,rna是一个有吸引力的治疗目标,因为他们是负责编码蛋白的生产。此外,大部分的人类基因组非编码rna和许多与疾病有关,包括遗传疾病和癌症。但RNA仍是一个难以达到的目标,很大程度上是因为缺乏知识,无论是在哪个小分子RNA折叠接受绑定和绑定到这些小分子RNA折叠。

”这些信息通常是未知的,它将允许一个推进gene-to-RNA-to-medicine管道,我们一直在努力做的,”说马修·迪斯尼斯克里普斯研究所的实验室一直致力于针对RNA了十多年的问题。人们不认为RNA可以选择性地靶向小分子和我想我们展示了一些例子确实可以。”

设计小分子RNA结合抗病毒药物——示意图

来源:Childs-Disney et al .,化学4,2018年10月1日到21日11日©2018爱思唯尔公司出版的。

筛选可用于发现目标特定的小分子RNA序列,这一技术,能找到新的药物来治疗病毒性疾病

建立在他们最近的研究,包括一个叫Inforna的筛选平台,发现与疾病有关的小分子RNA,迪斯尼和他的同事们收集有着更多的信息比以前RNA折叠和小分子之间的相互作用。有了这些信息,团队扩大概念通过识别网站的丙型肝炎病毒RNA基因组小分子可以结合。

分子的映射

收集所需的绑定信息,研究人员筛选图书馆30000小分子药物如发现近2000种化合物。这些被筛选对图书馆的RNA折叠绑定。这个发现的5200万种可能的相互作用可能是一种卓有成效的途径探索药物候选。研究小组发现239种化合物绑定RNA和使用结果的地图小分子RNA识别模式。通过比较与丙型肝炎病毒基因组地图的交互,可以识别病毒RNA序列,为特定的小分子结合位点进行合作,使团队确定一个小分子,抑制病毒复制。

这表明可以很快速的把化学库,到处都是,从学术界到行业,得到化合物结合的RNA为有利影响生物学治疗的好处,”迪斯尼说。这种方法的优点之一——原则上是季节性流感或季节性病毒出现时,可以迅速识别序列,然后设计小分子目标序列的折叠。

“目前,存在相当大的争议RNA是否“制药”和化合物是否目标RNA结构类似于那些目标蛋白质,”评论史蒂文·齐默尔曼调查RNA-targeted小分子,伊利诺斯州大学的我们。本文补充说支持,表明RNA结构有效将类似的传统药物。有趣的是,一些最有效的目标化合物的RNA违反利平斯基的一个或多个规则(经验法则用于评估药物如分子),这表明我们的观点构成的药物需要扩大。”

我们想规模进一步的设计,使小分子靶向RNA很常规,容易。这可能会改变一个范式在药物发现RNA是一种重要的药物小分子的目标,”迪斯尼说。这些领导会有人在漫长而曲折的道路上得到一个实际医学病人。”